Вы здесь

export PS1="(chroot) $PS1"

Скажите пожалуйста что это (в handbooke) не описано. (http://www.gentoo.org/doc/ru/handbook/handbook-x86.xml?part=1&chap=6)
(по теме: Листинг 5: Изменение корневого каталога для перехода в новую среду)
chroot, env-update, source сказано для чего а об этом нет.

Это просто изменит приглашение на ввод команды (которое хранится в переменной PS1), т.е. по умолчанию там вроде gentoo, а будет (chroot) gentoo. Это делается для того, чтобы вы не забыли где находитесь :)

Спасибо