Как увидеть "дерево пакетов" ?

посадил дед репку... и выросло дерево, да ещё и портажей

по теме - уточни вопрос

Может что-то типа emerge -pvte world

Для того, чтобы увидеть зависимости используй equery depends
а по поводу дерева... Для начала, это не дерево, а граф. Причем непланарный граф, то есть его нельзя изобразить на плоскости без самопересечений. А во вторых, он содержит несколько сотен, если не тысяч пакетов, то есть он огромен. Так что строить его бесполезно так как это будеть сущая мешанина. Ты из нее ничего не поймешь.