PORTDIR_OVERLAY

Мне в make.conf кто-то прописывает эту переменную на несуществующий (по моему) каталог. На время работы каких-то утилит она может прописываться? Как я понял, по умолчанию ее надо срезать в неустановленную?

Так создайте

Так создайте этот каталог и все

overlays

Не кто-то а что-то, вобще для этого смотри подробно dispatch-conf, когда будешь ставить что-то и с тебя будут требовать обновление /etc директории ( собственно файликов конфигурации )
А действительно создать этот каталог /usr/local/portage не сложно, все равно он управляется и обеспечивается пользователем =), так что сильно напрягаться за приватность не стоит ^_^
/me пользует несколько оверлеев и ничего - довольный ^_^
_________________
Best Wishes! LilFox...
Won't someone help me find my little Clare?

Настройки просмотра комментариев

Выберите нужный метод показа комментариев и нажмите "Сохранить установки".