Что это за ругань на .la-файлы?

Если при сборке какого-либо пакета emerge ругается на .la-файлы, например, так:

libtool: link: `/usr/lib/libGL.la' is not a valid libtool archive

Воспользуйтесь lafilefixer:
emerge lafilefixer && lafilefixer --justfixit
или просто
bash /usr/portage/dev-util/lafilefixer/files/lafilefixer-0.5 --justfixit