[РЕШЕНО] проблема пересбора системы после неправильно выставленных прав

нет смысла объяснять как так вышло, но от рута было выполнено:

chmod -R 777 /usr /opt

в результате чего разных багов образовалось достаточно. в процессе решения пришел к тому что надо "emerge -e world" и права восстановятся. но на всякий случай было закреплено

chmod -R 755 /usr /opt

теперь при попытке emerge -e world встает autoconf при попытке собрать iniparser:
http://dpaste.com/hold/751032/

sudo, chromium отказываются заводиться. мотивируют так:

b4x@annie ~ $ sudo
sudo: эффективный uid не равен 0, программа sudo установлена с битом setuid и принадлежит root?

b4x@annie ~ $ chromium
[2589:2589:5751760257:FATAL:zygote_host_impl_linux.cc(148)] The SUID sandbox helper binary was found, but is not configured correctly. Rather than run without sandboxing I'm aborting now. You need to make sure that /usr/lib64/chromium-browser/chrome_sandbox is owned by root and has mode 4755.
Аварийный останов

указывать права для каждой отдельной папки мне кажется неразумным, хотя рядом есть почти копия системы (если это может быть полезно).
1. есть ли способ решить проблему просто, без дополнительных телодвижений?
2. правильно ли я думаю, что autoconf встает именно из за неверно указанных прав? вывод сделал ввиду того что система работала идеально и проблем при установке/переустановке до этой ситуации не возникали.

make.conf:
http://dpaste.com/751035/

upd: пока нет решения, запустил

annie b4x # emerge -eav --keep-going world

чтобы он поправил все что может поправить.

upd: решение остается в направлении

emerge -eav --keep-going system

и

emerge --sync && emerge -avuDN --keep-going world

в несколько повторений.