Обновление системы, как правильней поступить?

если гном - то даже не знаю, что подсказать. был опыт попытки обновления системы на гноме, изначально поставленной не мной - чуть мозг не вывихнул. проще заново переставить и обновляться хотя бы раз в неделю.
по вопросу: если оно еще работает - может ну его? пусть работает? я сомневаюсь, что кто-то даст вам внятный ответ по вашей системе... в принципе, emerge -vuDN @system -p (и @world) покажет оптимальный (с его точки зрения) порядок обновления пакетов. Только вот что-то мне подсказывает, что когда вы наконец закончите эти обновления и снова синхронизируете дерево - у вас снова возникнет этот же вопрос. Правильнее отложить все дела на пару дней и посвятить их системе :)

Я бы сначала gcc переустановил до 4.5, чтоб в новый мир с новым компилятором:))(не факт что это правильно!)
А потом где наша не пропадала :))

emerge -uDNa world 

Ну так вообщем понятно, буду потихоньку тянуть все, так как не хочется потом танцевать с бубном вокург тон свежепоставленного софта.

смысл гоняться за новым gcc? И перелопачивать всю систему ???там разница в производительности не более 5% в лучшем случае а в архиваторах ну 10% от силы, а на деле подождать еще пару сек вот и вся разница! Тем более если не нужны лишние траблы - лучше сидите на стабильном gcc и лишний раз его трогать нету смысла вообще(имхо!)
А вообще по нормальному делается обновление так
1.Сначала смотришь что система хочет вам выдать с какими флагами ; может притянуть что-то не нужное по новым флагам/зависимостям и тд тп
2. Смотрите, корректируйте и вперед

PS ИМХО! вообще не вижу смысла для домашнего PC обновляться чаще чем раз в месяц а то и в 3 и уж тем более каждый раз менять gcc на новую версию ревизии пакета и затем перелопачивать вес мир =)

Можно не перепрыгивать с древнего portage на самый последний сразу, а делать это постепенно, благо есть архивы с portage.

Запустить emerge -pv world и обновлять порциями в порядке, предложенном emerge'ем

в таких случаях, обновляю только часть пакетов. т.е. выборочно.

Это вопрос предпочтений. Одни люди любят долго не обновляться, а потом разом переустановить Убунту на свежевышедшую.
Другие люди не хотят допускать ситуации "очень много обновлений", и обновляются часто.
Как правильнее поступить? Выбрать, какой путь вам ближе ("не обновляться, а потом разом переустановить" или "обновляться часто и не страдать").

Если portage-2.2 - то обновляться можно вполне безопасно, но с оглядкой, все же. Вы врядли себе сломаете систему полностью обновлением (хотя могут обновится некоторые приложения, которые зависят от библиотек поменявших API без смены so-name), но словите кучу ошибок компиляции - это я гарантирую.

Порядок, имхо, лучше делать следующий:
1) portage (2.2 какой-нить)
2) python
3) python-updater
4) glibc
5) @system
6) perl (если еще не обновился)
7) perl-cleaner --reallyall
8) @system (на всякий случай)
9) @world

Ну, и в зависимости от установленного софта, радостей у вас может быть много.

В вашей ситуации, как мне кажется самое опасное, это не сам факт обновления кучи пакетов, а возможное изменение директив в конфигурационных файлах. Может случиться что какой-то пакет будет ругаться на синтаксис конфиг файла, так что я вам советую сначало сохранить все ваши конфиги, потом, после обновления, вдумчиво и долго корпеть над etc-update.

Если что вдруг будет надо, мой скрипт обновления:

eix-sync &&
emerge --update --newuse --deep world &&
emerge -a --depclean &&
revdep-rebuild &&
eclean distfiles &&
glsa-check -t all

обновлений бояться - генту не ставить ;))

не вижу никаких причин для паники! ;)